新型冠状病毒溯源:究竟是哪种野味带来的灾难?

栏目:热点资讯  时间:2020-02-23
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  导读

  在抗击新型冠状肺炎病毒的战役里,医者逆行坚守,科学也在前行溯源。

  1 月 20 日,钟南山院士指出,此次新型冠状病毒来源很大可能是野生动物,具体是什么动物,还不清楚。

  1 月 21 日,中国科学院上海巴斯德研究所等几个研究机构在线发表论文,推测新型冠状病毒的自然宿主也可能是蝙蝠。

  1 月 22 日,北京大学、广西中医药大学等单位联合发表论文称:蛇可能是造成当前武汉新型冠状病毒 2019-nCoV 感染爆发的野生动物库。

  同日,Nature 刊文评论指出,没有任何证据表明蛇是新型冠状病毒的宿主。

  1 月 23 日,中国科学院武汉病毒研究所石正丽团队将 2019-nCoV 的来源再次指向蝙蝠,并表明该病毒与一种蝙蝠的冠状病毒基因序列一致性高达 96.2%。

  同日晚,国家卫健委高级别专家组成员、中国疾病预防控制中心主任高福表示:新型冠状肺炎病毒来自野生动物,证据确凿。

  1 月 24 日,《柳叶刀》在线发表有关 2019 新型冠状病毒研究的论文结论中指出,2019-nCoV 很可能与中华菊头蝠携带的冠状病毒密切相关。

  确认新型冠状病毒的中间宿主和自然宿主,有利于控制传染源及研究治疗药物。

  本文作者:刘漫

  从 SARS 到 MERS,都与野味有关

  非典 SARS 冠状病毒和中东呼吸综合征 MERS 冠状病毒肆虐的流窜中,有着果子狸、蝙蝠、单峰骆驼等野生动物的身影。

  武汉华南海鲜批发市场,这个华中地区最大的海鲜市场,作为疫情最早的起源地,它的名字在 2019 年末因为不明原因肺炎广为流传,

  华南海鲜市场关停后,有记者暗访发现,种类丰富的野味菜单、混杂的野生动物、不缺的客户群体,都坐实了市场内卖野味的信息——这一信息表明,新型冠状病毒 2019-nCoV 有可能也和野生动物的传播有关。

  海鲜与野味同卖,野生动物病毒因此被迫走向人类社会,在交通高度发达,人类彼此充分交汇接触的当代社会,四处流窜。

  确认 2019-nCoV 的中间宿主和自然宿主,有利于控制传染源及研究治疗药物。在一线救治的同时,科研工作者们一直在紧锣密鼓地追踪 2019-nCoV 的源头。

  1 月 21 日,钟南山院士表示,「这个病源,它的源头是什么动物,现在基本不清楚。只是从各方面的流行病学的调查的话,是来自一个野生动物。」

  2019-nCoV 究竟来源于哪种野生动物?不同的研究者用各自的方式探索着。

  

  图片来源:央视新闻

  蛇?蝙蝠?探索中溯源

  2020 年 1 月 21 日,中国科学院上海巴斯德研究所等机构在线发表论文,对新型冠状病毒属于 Beta 冠状病毒属进行确认。

  由于新型冠状病毒的进化邻居和外类群,也就是演化关系上最为接近的类群,都能在各类蝙蝠中发现,因此有合理推测认为,新型冠状病毒的自然宿主也可能是蝙蝠。

  次日,北京大学、广西中医药大学等单位将联合完成的研究发表于《医学病毒学杂志》(Journal of Medical Virology)。

  

  图片来源:论文网页截图

  研究团队通过比对不同物种之间的相对同义密码子使用偏好(RSCU)来与新型冠状病毒的现有序列,从而判断病毒起源。

  构成密码子的三个氨基酸通过不同的排列组合却编码同一氨基酸时,这些密码子就被成为同义密码子。不同物种对排列组合的偏好程度有差异,这就可以用来作序列分析和比对。

  分析结果表明,与刺猬、穿山甲等其他动物相比,2019-nCoV 的RSCU 与蛇类似。因此,该文研究结果指出,蛇最有可能是该病毒感染爆发的野生动物库。

  这篇文章刚发表在线就引发了争议,被时刻关注的国外学者提出质疑,「蛇不可能是传播新型冠状病毒的宿主」。

  

  图片来源:Nature 网页截图

  在 Nature 发布的一篇文章中,圣保罗大学的一位病毒学家公开表达质疑:「他们没有证据表明蛇可以被这种新的冠状病毒感染并作为宿主,除了哺乳动物和鸟类以外,不存在一致的证据证明其他宿主中存在 beta 冠状病毒。」

  同样是这一天,中科院武汉病毒研究所石正丽团队在 bioRxiv 发布研究证实,武汉新型冠状病毒的动物宿主最可能同 SARS 一样,还是蝙蝠。

  

  图片来源:biRxiv网页截图

  从 04 年开始,石正丽及其团队就在探寻 SARS 病毒自然宿主,分离检测各种蝙蝠体内与其高度同源的病毒。将足迹遍布大江南北数十个省市后,他们搜集的样本为 SARS 病毒起源于蝙蝠这一推测提供了极为有利的证据。

  「在生物信息学的分析下,我们最后证明了 SARS 病毒是经过几个蝙蝠 SARS样冠状病毒重组而来的。」石正丽团队的这一研究结果也刊登在 Nature。

  在对新型冠状病毒的探究中,石正丽团队凭借以往的积累与经验,发现2019-nCoV 与一种蝙蝠携带的冠状病毒的序列一致性高达 96%。

  研究团队利用生物信息学的方法,把从有限的几个病人身上分离出来的病毒同各种哺乳动物及蝙蝠冠状病毒进行比对,判断其来源。

  这一实验过程和结果得到了国内外很多学者的认同,而正因为石正丽实验室已经有了以前十数年的积累探索,才能在如此短时间内就做出成果。

  此外,除了提出病毒很可能来自蝙蝠外,该研究结论还指出,新型冠状病毒进入细胞的受体和 SARS 病毒一样,都是 ACE2 病毒结合受体,这一结论有助于测试 候选受体抑制剂就是否能够有效抑制新型冠状病毒。

  

  图片来源:石正丽文章 Figure

  期待科学界的更多关注

  到目前为止,依旧没有研究能完全明确造成此次新型冠状病毒肺炎的宿主,但可以肯定的是,食用野味、接触野生动物的行为,依然在野生动物病毒传播至人类社会中扮演者「元凶」。

  追踪祸首在有序的铺展,与之并行的是关注疾病。

  1 月 24 日,国家卫健委高级别专家组成员、中国疾病预防控制中心主任高福表示:「 新型冠状病毒不仅在感染的人体内被检测到,在华南海鲜市场非法销售野生动物的摊位也分离了出来, 这说明新型冠状病毒来自野生动物,应该是证据确凿的」 。

  同日,权威医学杂志《柳叶刀》推出「冠状病毒」专题,通过 2 篇研究论文以及评论文章,对新型冠状病毒的临床研究予以关注。 其中一篇研究指出, 2019-nCoV 很可能与中华菊头蝠携带的冠状病毒密切相关。

  另一篇研究的作者,来自香港大学的 Dr. Rosana Wing-Shan Poon 则表示:「SARS 的爆发是从动物传人(由动物到人类传播) 开始,从中汲取经验教训, 所有野生动物肉类交易都应受到更好的监管,以终止这种潜在的传播途径。」

  对于新型冠状病毒的起转归结,我们似乎是研究出了一些结果,可留待更多的仍是未知。

  蛇还是蝙蝠?是什么蝙蝠?目前仍然没有明确的结论。

  在抗击新型冠状肺炎病毒的战役里,医者逆行坚守,科学也在前行溯源。 我们相信,科学在前行。 (责任编辑:gyouza)

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